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注冊(cè)人必看:IVD產(chǎn)品臨床試驗(yàn)樣本量估算方法分享2
分類:知識(shí)問答 發(fā)布時(shí)間:2023-03-05 作者: IVDEAR 瀏覽量: 888
今天我們分享一些比較常用且非常實(shí)用的臨床樣本量的確定方法。

很多IVD企業(yè)在開展臨床試驗(yàn)研究時(shí)經(jīng)常會(huì)碰到這樣的問題:臨床入組樣本量應(yīng)具有統(tǒng)計(jì)學(xué)參考意義,但在沒有相關(guān)產(chǎn)品臨床試驗(yàn)CS指南文件的情況下,不清楚應(yīng)該怎么去確定產(chǎn)品需要入組多少樣本量。

今天,IVDEAR團(tuán)隊(duì)為您分享一些比較常用且非常實(shí)用的臨床樣本量的確定方法。

一、常見的定性試劑的樣本估算原理和公式

1. 《體外診斷試劑臨床試驗(yàn)技術(shù)指導(dǎo)原則》介紹了基于統(tǒng)計(jì)學(xué)要求的最低樣本量估計(jì)的相關(guān)公式。根據(jù)臨床需要設(shè)定適當(dāng)?shù)呐R床可接受標(biāo)準(zhǔn),也就是單組目標(biāo)值法樣本量估算法,是采用下面公式分別估算陽性和陰性樣本。圖片 

估算陽性和陰性樣本(2).png

n:樣本量;

α:一類錯(cuò)誤概率,一般設(shè)定為雙側(cè)0.05或單側(cè)0.025;

β:二類錯(cuò)誤概率,設(shè)定為不大于0.2,一般按0.2計(jì)算;

Z(1-α/2):顯著性水平的標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)分布的分?jǐn)?shù)位,Z(0.975)=1.96;

Z(1-β):把握度的標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)分布的分?jǐn)?shù)位,Z(0.8)=0.84;

P0:評(píng)價(jià)指標(biāo)的臨床可接受標(biāo)準(zhǔn);

PT:試驗(yàn)體外診斷試劑評(píng)價(jià)指標(biāo)預(yù)期值;

(PT- P0):總體參數(shù)差異。 

估算示例1:首先將提前公式輸入,然后在E,H列分別輸入靈敏度可接受標(biāo)準(zhǔn)85%和靈敏度預(yù)期值94%,可計(jì)算得出陽性樣本至少需100例(有小數(shù)建議進(jìn)一位取整,其他案例同理),考慮10%的脫落率計(jì)算后,可計(jì)算得出陽性樣本至少需111例。

Fig. 1 估算示例1).png

 Fig. 1 估算示例1

同理,可在E,H列分別輸入特異性可接受標(biāo)準(zhǔn)90%和特異性預(yù)期值95%,計(jì)算得出陰性樣本至少需264例(如Fig1, 右)。

2. 根據(jù)需要,只保證評(píng)價(jià)指標(biāo)滿足期望精度水平(置信區(qū)間的寬度一定),而不設(shè)定臨床可接受標(biāo)準(zhǔn)的情況,可采用如下公式:

不設(shè)定臨床可接受標(biāo)準(zhǔn)的情況,可采用如下公式(2).png

公式中:

n:樣本量;

Z(1-α/2):顯著性水平的標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)分布的分?jǐn)?shù)位,一般設(shè)定為雙側(cè)0.05或單側(cè)0.025;

Z(0.975)=1.96;

P為評(píng)價(jià)指標(biāo)預(yù)期值,Δ為P的允許誤差大小。

采用上述公式,可根據(jù)靈敏度或特異度的預(yù)期值分別估算具有目標(biāo)疾病狀態(tài)的受試者(陽性)或不具有目標(biāo)疾病狀態(tài)的受試者(陰性)的樣本量。

估算示例2:按照示例1中方式一步一步提前輸入公式即可。分別輸入預(yù)期靈敏性85%和預(yù)期特異性95%,允許誤差Δ設(shè)定為0.05,依次可計(jì)算得出陽性樣本至少需218例,陰性性樣本至少需82例(考慮10%脫落率)。

注:上述方程是基于二項(xiàng)分布的正態(tài)近似,當(dāng)TPF或FPF接近1.0時(shí),這個(gè)假設(shè)就失效了。

3. 另外,當(dāng)靈敏度或特異度小于20%或大于80%時(shí),樣本率的分布呈偏態(tài),需對(duì)符合率的平方根進(jìn)行反正弦轉(zhuǎn)換,樣本量計(jì)算公式為:

樣本量計(jì)算公式.png

公式中:

n:樣本量;

Zα:1.96;

σ:一般取0.08;

p:靈敏度或特異性的符合率。

估算示例3:假設(shè)預(yù)期靈敏度85%和預(yù)期特異性80%,允許誤差Δ設(shè)定為0.05,依次可計(jì)算得出陽性樣本至少需84例,陰性性樣本至少需106例(考慮10%脫落率)。

二、定量檢測(cè)的樣本量估算

定量檢測(cè)可根據(jù)相關(guān)系數(shù)估算樣本量,公式計(jì)算,公式如下:

定量檢測(cè)的樣本量估算.png

公式中:

n:樣本量;

a:一類錯(cuò)誤概率,設(shè)定為雙側(cè)0.05或單側(cè)0.025;

β:二類錯(cuò)誤概率,一般按0.2計(jì)算;

Z(1-α/s)和Z(1-β)表示對(duì)應(yīng)于α和β的標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)分布百分位數(shù);

s這里指的是單側(cè)或雙側(cè)檢驗(yàn),s=1為單側(cè),s=2為雙側(cè);

p0為相關(guān)系數(shù)可接受標(biāo)準(zhǔn)值,p1為預(yù)期相關(guān)系數(shù)值。

估算示例4:根據(jù)CLSI EP9-A2文件的標(biāo)準(zhǔn),對(duì)比試劑與候選試劑的直線相關(guān)系數(shù)不得低于0.975(p0),那我們假設(shè)線性系數(shù)為0.985(p1)設(shè)定單側(cè)參數(shù):S=1, a=0.025,β=0.2,根據(jù)上面的公式我們可以計(jì)算出,樣本量n為121例。如果考慮10%的脫落剔除率,那么最低樣本量為121/0.9=135例。

三、計(jì)算樣本量軟件

除了上述樣本量計(jì)算公式外,也可以直接借助軟件來計(jì)算,今天小編將重點(diǎn)介紹如下兩種軟件。

1、利用PASS軟件估算樣本量的方法

(1) PASS

PASS(Power Analysis and Sample Size)美國NCSS公司開發(fā),能對(duì)數(shù)十種統(tǒng)計(jì)學(xué)檢驗(yàn)條件下的檢驗(yàn)效能和樣本含量進(jìn)行估計(jì)。

(2) PASS操作

估算原理:采用單組目標(biāo)值類似原理。在左側(cè)界面中依次選擇“Procedures—“Sensitivity and Specificity—“Test for One-Sample Sensitivity and Specificity”,然后在面板設(shè)置好各個(gè)參數(shù),分別進(jìn)行靈敏度和特異性的樣本計(jì)算,最后軟件計(jì)算出不同疾病流行率下所需的最少樣本數(shù)量,如 Fig.2所示。

設(shè)置參數(shù)界面.png

Fig.2 設(shè)置參數(shù)界面

參數(shù)界面和結(jié)果.png

Fig.2 參數(shù)界面和結(jié)果

結(jié)果解釋:分別進(jìn)行陽性、陰性樣本量估算,每次估算可得到不同疾病流行率下,診斷靈敏度或診斷特異性所需的陽性和陰性樣本估算結(jié)果,最終陽性和陰性樣本量取兩次估算值的較大值。

2、IVD statistics

可以分別計(jì)算定性、定量產(chǎn)品的樣本量,另外還可以進(jìn)行靈敏度、特異性,置信區(qū)間、KAPPA,ROC等分析。如Fig.3,根據(jù)既定的相關(guān)參數(shù)進(jìn)行設(shè)置后計(jì)算出結(jié)果。

IVD statistics樣本量計(jì)算.png

Fig.3 IVD statistics樣本量計(jì)算

根據(jù)既定的相關(guān)參數(shù)進(jìn)行設(shè)置后計(jì)算出結(jié)果。

3、討論

本文中介紹了定性樣本量計(jì)算公式,原理是基于可接受標(biāo)準(zhǔn),指定置信區(qū)間寬度進(jìn)行計(jì)算。另外,當(dāng)靈敏度或特異度小于20%或大于80%時(shí),樣本率的分布呈偏態(tài)的定性產(chǎn)品的樣本量如何計(jì)算,以及對(duì)于定量產(chǎn)品,可以采用相關(guān)系數(shù)檢驗(yàn)的公式來估算樣本量。

除此之外,本文還展現(xiàn)了PASS和IVD statistics軟件。PASS軟件需考慮疾病流行率來計(jì)算樣本量大小。但是由于流行率的參數(shù)來源于相關(guān)文獻(xiàn)記錄或者疾病控制中心的實(shí)時(shí)監(jiān)控和統(tǒng)計(jì),考慮疾病的流行率后,那代表同一個(gè)疾病在不同流行期、不同地域都會(huì)有變化,實(shí)際執(zhí)行較為困難。

當(dāng)然,需要注意的是,以上樣本量估算方法僅是一些比較常用及實(shí)用的方法。而具體到臨床試驗(yàn)方案的總體設(shè)計(jì)上,還需要臨床技術(shù)專家根據(jù)具體的臨床試驗(yàn)項(xiàng)目且結(jié)合法規(guī)、競(jìng)品、經(jīng)驗(yàn)等多方面因素綜合考量和打磨而最終敲定。

四、IVD產(chǎn)品注冊(cè)、臨床試驗(yàn)研究

聊到這里,小編想說:IVDEAR團(tuán)隊(duì)可以幫助您精心設(shè)計(jì)試驗(yàn)方案和高效完成臨床試驗(yàn)研究報(bào)告,協(xié)助您快速取證。

目前我們可承接開展以下體外診斷試劑產(chǎn)品的注冊(cè)及臨床試驗(yàn)研究:如腫瘤標(biāo)志物檢測(cè)試劑、糖尿病相關(guān)檢測(cè)試劑、激素指標(biāo)檢測(cè)試劑、心肌標(biāo)志物檢測(cè)試劑、炎癥指標(biāo)檢測(cè)試劑、呼吸道病原體檢測(cè)試劑、傳染病檢測(cè)試劑、血型檢測(cè)試劑、甲基化檢測(cè)產(chǎn)品等產(chǎn)品的臨床試驗(yàn)研究,覆蓋了大部分的IVD產(chǎn)品類別。

有相關(guān)項(xiàng)目需求的企業(yè)請(qǐng)聯(lián)絡(luò)IVDEAR團(tuán)隊(duì)。